68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2848 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  98.04 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  93.63 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  93.63 
 
 		 204 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  93.63 
 
 		 204 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  93.63 
 
 		 204 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  92.16 
 
 		 204 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  80.39 
 
 		 204 aa  330  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  79.9 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  79.9 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  79.9 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  79.41 
 
 		 204 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  79.41 
 
 		 204 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  79.41 
 
 		 204 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  79.41 
 
 		 204 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  71.86 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  71.36 
 
 		 202 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  74.62 
 
 		 197 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  48.09 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  50.56 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  47.54 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  47.54 
 
 		 210 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  43.26 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  37.7 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  37.17 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  31.31 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  31.61 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  31.53 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  31.28 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  29.23 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  31.05 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  29.73 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  29.28 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  28.65 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  29.47 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  25.53 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  28.18 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  28.02 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  28.37 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  27.96 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  33.04 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  28.76 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  28.1 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  34.74 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  30.82 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  29.45 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  27.11 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  27.17 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  22.15 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  27.23 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  25.17 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  24.87 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  25.93 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  27.01 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  23.49 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  21.77 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  21.48 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  24.86 
 
 		 190 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  25.22 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  25.22 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  25.22 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  25.22 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>