63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0358 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  72.06 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  62.25 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  60.78 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  59.8 
 
 		 210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  47.96 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  45.92 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  45.41 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  43.78 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  42.7 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  43.85 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  39 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  44.57 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  38.69 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  42.2 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  42.2 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  42.2 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  41.71 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  32.64 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  32.64 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  30.89 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  30.89 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  30.73 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  28.35 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  29.26 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  35.42 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  28.34 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  25.82 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  28.24 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  27.65 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  35.16 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  28.06 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  25.73 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  25.73 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  27.12 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  25.99 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  24.49 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  23.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  21.76 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  26.82 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  24.52 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  22.49 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  22.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  21.55 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  21.3 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  29.05 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  28.38 
 
 		 190 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>