64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0329 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  81.63 
 
 		 202 aa  347  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  80.61 
 
 		 202 aa  347  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  74.11 
 
 		 204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  73.6 
 
 		 204 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  74.62 
 
 		 204 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  75.26 
 
 		 204 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  75.26 
 
 		 204 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  75.26 
 
 		 204 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  75.26 
 
 		 204 aa  287  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  74.74 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  74.74 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  74.74 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  74.74 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  73.6 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  73.6 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  74 
 
 		 204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  73.6 
 
 		 204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  50 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  49.45 
 
 		 210 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  50.28 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  48.9 
 
 		 210 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  47.89 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  41.45 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  42.63 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  32.81 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  34.2 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  31.22 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  32.12 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  32.04 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  30.69 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  32.42 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  32.62 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  29.23 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  29.17 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 233 aa  88.2  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  30.5 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  28.49 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  27.89 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  27.86 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  24.16 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.13 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.76 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  25.15 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  28.66 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  21.95 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  26.28 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  21.79 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  22.97 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  22.7 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  23.08 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  20.41 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2223  hypothetical protein  26.67 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  18.78 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>