46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0152 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  62.93 
 
 
205 aa  262  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  63.05 
 
 
206 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  62.56 
 
 
206 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  57.43 
 
 
205 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  54.59 
 
 
201 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  54.59 
 
 
236 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  51.5 
 
 
211 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  52.04 
 
 
237 aa  201  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  45.69 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  37.31 
 
 
231 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  29.08 
 
 
213 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  29.9 
 
 
202 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  30.69 
 
 
197 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  30.48 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  30.65 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  30.26 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  29.23 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  28.98 
 
 
204 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  30 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  30.21 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  25.79 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  27.57 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  29.44 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.67 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  31.58 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  27.03 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.14 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  23.3 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  23.3 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  21.28 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  21.28 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>