42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4106 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  78.92 
 
 		 236 aa  344  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  61.66 
 
 		 206 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  61.14 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  52.63 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  54.82 
 
 		 205 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  53.03 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  52.5 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  52.04 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  39.9 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  35.83 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  31.22 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  28.35 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  28.35 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  29.73 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  29.51 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  29.57 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  26.76 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  29.79 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  28.32 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  28.32 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  28.32 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  28.32 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  27.46 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  27.87 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  27.87 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  28.88 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  27.08 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.38 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  25.68 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  22.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>