45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6049 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  67.84 
 
 		 205 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  64.85 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  66.32 
 
 		 206 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  58.88 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  54.15 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  57.43 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  52.97 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  52.5 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  48.7 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  39.2 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  31.79 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  30.41 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  31.28 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  30.57 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  29.53 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  32.62 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  30.9 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  30.9 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  30.9 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  30.34 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  29.44 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  26.67 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  29.74 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  27.96 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  24.62 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  27.96 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  31.12 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.13 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  26.34 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.9 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  23.56 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  21.16 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  27.59 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  28.86 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>