51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0536 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  34.78 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  31.85 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  30.94 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  28.8 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  27.12 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  28.27 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  30.5 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  26.82 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  27.78 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  27.46 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  24.86 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  29.08 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  27.75 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  24.31 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  27.69 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  22.56 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  25.65 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  24.19 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  23.66 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  24.04 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  30.08 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  28.7 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  23.46 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  24.31 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  22.16 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  24.04 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  30.7 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  26.72 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  22.83 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  20.45 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  25.77 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  20.55 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  24.26 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>