34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0957 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  54.35 
 
 
191 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  44.32 
 
 
189 aa  174  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  44.32 
 
 
189 aa  174  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  26.28 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  27.03 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.42 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  26.29 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  25.51 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.57 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  27.78 
 
 
229 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  25.51 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  24.36 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  29.17 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  23.72 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  23.66 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  24.19 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  23.24 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  24.86 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  24.31 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  25.28 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  25.28 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  24.32 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  24.32 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  24.32 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  23.4 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2223  hypothetical protein  31.76 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  22.04 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  30.36 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  23.37 
 
 
236 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  23.08 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>