78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3958 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  97.31 
 
 		 186 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  93.01 
 
 		 186 aa  357  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  85.48 
 
 		 186 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  85.48 
 
 		 186 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  85.48 
 
 		 186 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  84.95 
 
 		 186 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  67.2 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  67.74 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  69.35 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  68.11 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  62.9 
 
 		 186 aa  243  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  56.52 
 
 		 186 aa  220  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  53.48 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  30.65 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  31.64 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  28.04 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  27.4 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  23.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  23.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  23.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  23.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  28.19 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  22.83 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  27.66 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  27.72 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  25.5 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  24.38 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  21.74 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  29.45 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  22.58 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  26.32 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  23.73 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  24 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  27.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  24.83 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  22.97 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  26.99 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  28.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  24.66 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  23.4 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  23.4 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  22.58 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  22.04 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  22.82 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  23.81 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  23.18 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  24.73 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  26.13 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  20.63 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  26.35 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  26.49 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  20.24 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  22.97 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  20 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  20.41 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  21.55 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  25.77 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  25.83 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  25.83 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  21.51 
 
 		 190 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  25.83 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  23.58 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  21.43 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>