30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0673 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  96.3 
 
 
189 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  53.19 
 
 
191 aa  222  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  44.32 
 
 
191 aa  147  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  27.75 
 
 
229 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.53 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.85 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.66 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.66 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  22.83 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  24.5 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  22.58 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  22.87 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  22.04 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  28.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  28.43 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  23.89 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  22.91 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  24.74 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  24.74 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  23.61 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  24.73 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  24.74 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  24.21 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  24.86 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  27.04 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  23.53 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  22.7 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  24.32 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  20.11 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>