52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4540 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  31.91 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  29.47 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  34.95 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  31.55 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  31.84 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  31.84 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  31.84 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  31.84 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  31.72 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  32.77 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  32.77 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  32.2 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  31.02 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  32.77 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  31.64 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  28.49 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  28.38 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  23.76 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  25.97 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  24.67 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  28.02 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  20.99 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  21.62 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  25.83 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  23.74 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  23.31 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  23.7 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  23.39 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  22.4 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>