14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0335 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  37.26 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  28.77 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  31.4 
 
 
239 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  26.87 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  25.46 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  24.41 
 
 
258 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  26.88 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  26.09 
 
 
237 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  25.74 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  25.74 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  28.48 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  24.46 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>