25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0108 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  34.22 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  29.25 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  32.98 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  28.06 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  34.44 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  27 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  33.56 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  26.32 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  26.6 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  23.67 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  26.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  24.24 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  29.61 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  28.23 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  28.23 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  26.09 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  25.37 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  24.75 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  24.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  26.43 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  25.74 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>