40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0195 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  30.1 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  31.61 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  29.05 
 
 		 274 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  29.74 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  28.5 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  34.44 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  27.51 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  33.99 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  31.05 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  31.05 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  29.47 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  30.3 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  30.3 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  31.29 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  30.38 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  32.3 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  32 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  27.13 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  23.66 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  26.34 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  26.83 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  26.32 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  26.07 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  32.85 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  28.16 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  27.53 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  27.32 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  24.75 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  23.83 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  23.96 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  27.04 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  24.18 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  26.53 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  21.24 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3851  hypothetical protein  23.98 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.855967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>