32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3670 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  41.79 
 
 
217 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  41.79 
 
 
255 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  38.89 
 
 
237 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  34.02 
 
 
222 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  30.28 
 
 
221 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  31.03 
 
 
221 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  34.25 
 
 
230 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  31.19 
 
 
258 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  32.02 
 
 
221 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  29.61 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  28.99 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  32.65 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  30.1 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  29.08 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  32.8 
 
 
239 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  29.15 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  29.9 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  32.99 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  32.99 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  28.24 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  26.03 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  32.18 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  27.75 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  26.53 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  24.4 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  22.12 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  26.53 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  25.37 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  27.54 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1604  protein of unknown function DUF1239  28.65 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.784083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  24.63 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>