22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4955 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  45.5 
 
 
206 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  32.11 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  28.72 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  24.63 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  24.62 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  27.81 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  25.46 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  27.55 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  24.21 
 
 
244 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  24.27 
 
 
241 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  26.81 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  23.59 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  23.32 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  23.62 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  24.11 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  29.52 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  23.68 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  25.41 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  26.17 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.25534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>