21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1154 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  99.51 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  81.86 
 
 		 204 aa  333  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2607  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  35.35 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0026  hypothetical protein  38.97 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3851  hypothetical protein  29.95 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.855967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3587  hypothetical protein  32 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  26.07 
 
 		 239 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  31.07 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  29.71 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  25.89 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  26.18 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  26.04 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  23.59 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  27.64 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  23.96 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  28.09 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  23.96 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  28.43 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>