More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7277 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  49.44 
 
 
901 aa  848    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  53.54 
 
 
931 aa  885    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
892 aa  1798    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  61.16 
 
 
902 aa  1102    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  52.74 
 
 
898 aa  885    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  74.07 
 
 
899 aa  1306    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  54.65 
 
 
917 aa  949    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.49 
 
 
895 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  42.03 
 
 
1072 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
1112 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  41.95 
 
 
1078 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  44.08 
 
 
1050 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  43.29 
 
 
1006 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 
1047 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  42.88 
 
 
1047 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  44.56 
 
 
1074 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
1048 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  43.88 
 
 
1033 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  44.22 
 
 
1013 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  41.3 
 
 
924 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
1007 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  45.62 
 
 
1019 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  43.88 
 
 
1019 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.76 
 
 
933 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
918 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.19 
 
 
918 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.19 
 
 
918 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.19 
 
 
918 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.19 
 
 
918 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.12 
 
 
918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.03 
 
 
918 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 
925 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  40.58 
 
 
1185 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.12 
 
 
918 aa  439  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.79 
 
 
918 aa  439  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.48 
 
 
918 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  40.09 
 
 
1048 aa  438  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  41.93 
 
 
1007 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
918 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
1028 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  39.82 
 
 
980 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  39.85 
 
 
886 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  42.99 
 
 
1040 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
1152 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  38.19 
 
 
1175 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  41.98 
 
 
958 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.83 
 
 
1067 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.81 
 
 
1029 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  40.72 
 
 
990 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  42.79 
 
 
1065 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  38.28 
 
 
1194 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  41.95 
 
 
1063 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  42.37 
 
 
1099 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  45.03 
 
 
1531 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  40.98 
 
 
903 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  38.91 
 
 
988 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.85 
 
 
1026 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  40.63 
 
 
949 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  42.88 
 
 
621 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 
617 aa  348  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.56 
 
 
1087 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  38.26 
 
 
1069 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  37.67 
 
 
1069 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.09 
 
 
1125 aa  328  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.75 
 
 
1082 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
1068 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.8 
 
 
1082 aa  320  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.25 
 
 
1062 aa  320  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.48 
 
 
1130 aa  318  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
1055 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.04 
 
 
1077 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.89 
 
 
1108 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 
1139 aa  311  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 
1112 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
982 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.97 
 
 
876 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  31.82 
 
 
1031 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.32 
 
 
1084 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.45 
 
 
977 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.1 
 
 
1086 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
1104 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.8 
 
 
1068 aa  308  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  42.92 
 
 
1105 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  37.91 
 
 
1084 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 
1066 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 
1021 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  42.94 
 
 
666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  35.24 
 
 
1064 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.45 
 
 
1068 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.38 
 
 
1129 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.93 
 
 
1064 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  42.74 
 
 
1105 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  38.28 
 
 
1080 aa  301  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  39.71 
 
 
1386 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
1091 aa  300  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 
1110 aa  300  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  37.43 
 
 
1073 aa  299  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  39.71 
 
 
1362 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.12 
 
 
1178 aa  298  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
1073 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>