269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0423 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0423  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00223859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 
366 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
365 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2426  Prephenate dehydrogenase  31.09 
 
 
282 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.68 
 
 
780 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.9 
 
 
778 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10140  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127595  hitchhiker  0.000000666902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  24.33 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  24.33 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.48 
 
 
770 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23 
 
 
735 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
270 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  24.32 
 
 
534 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  22.65 
 
 
746 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  24.83 
 
 
286 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
280 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.69 
 
 
746 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.69 
 
 
746 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  24.2 
 
 
286 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.34 
 
 
746 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.69 
 
 
746 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 
290 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  24.21 
 
 
291 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  22.37 
 
 
308 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  22.26 
 
 
750 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  27.97 
 
 
318 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.48 
 
 
748 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 
280 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.04 
 
 
746 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.22 
 
 
742 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  20.75 
 
 
298 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 
286 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  24.15 
 
 
288 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
363 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  23.16 
 
 
288 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
363 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.34 
 
 
746 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  22.3 
 
 
535 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  23.96 
 
 
286 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 
312 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  21.5 
 
 
302 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 
286 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
280 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  24.48 
 
 
307 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  22.22 
 
 
300 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  23.99 
 
 
290 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  20.07 
 
 
334 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  21.75 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.39 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  23.45 
 
 
373 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  23.61 
 
 
294 aa  99  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  22.37 
 
 
329 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 
283 aa  99  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  22.37 
 
 
329 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  22.42 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  23.13 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  22.88 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
367 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  22.15 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  22.22 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  23.43 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.04 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  22.22 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  21.45 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  21.4 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  26.41 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  21.6 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.03 
 
 
311 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  22.03 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  24.43 
 
 
375 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  21.65 
 
 
379 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  23.39 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  25.2 
 
 
339 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.52 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  21.65 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  21.25 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 
301 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  24.74 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  22.31 
 
 
356 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  21.58 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  21.4 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.83 
 
 
314 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  22.41 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 
369 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  26.47 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  22.07 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  22.07 
 
 
297 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  22.73 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  24.74 
 
 
312 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  23.7 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  22.56 
 
 
388 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  22.22 
 
 
752 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  22.38 
 
 
348 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  23.9 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>