296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10140  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 305 aa  634    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127595  hitchhiker  0.000000666902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.41 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0423  Prephenate dehydrogenase  26.99 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00223859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2426  Prephenate dehydrogenase  29.92 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  29.05 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  29.05 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.26 
 
 		 367 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  29.63 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  26.6 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  24.24 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 		 364 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.3 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  27.65 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  30.62 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.69 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  29 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.87 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.37 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.16 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.43 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.43 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.85 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  28.74 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  27.45 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.09 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  27.14 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28.01 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.61 
 
 		 748 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  25.67 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.24 
 
 		 750 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.74 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  27.82 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  27.99 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.84 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.09 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.26 
 
 		 746 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.09 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  25.28 
 
 		 280 aa  96.3  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  24.3 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.26 
 
 		 746 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.31 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  27.85 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.89 
 
 		 746 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 		 534 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.34 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.14 
 
 		 735 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  24.03 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  24.54 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  24.04 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.39 
 
 		 378 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 		 366 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  25.98 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.21 
 
 		 746 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>