More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4462 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  84.4 
 
 		 141 aa  238  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  82.98 
 
 		 141 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  80.85 
 
 		 141 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  80.85 
 
 		 141 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  80.85 
 
 		 141 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  78.72 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  68.55 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  67.2 
 
 		 147 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 183 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  68.33 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  60.15 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  65.83 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  57.6 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  58.4 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  56.8 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  49.65 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  53.44 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 159 aa  140  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  51.97 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.09 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.3 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  33.07 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.13 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  41.88 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  30 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  35 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  32.52 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  30.89 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.77 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.3 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  32.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.43 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  35.25 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2950  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  28.91 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.5 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  38.02 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  35.04 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.04 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.04 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>