More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4157 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 374 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  80 
 
 		 377 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  77.15 
 
 		 374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  84.48 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  84.48 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  84.48 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  76.34 
 
 		 374 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  65.42 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  71.38 
 
 		 316 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  67.83 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  53.78 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  51.56 
 
 		 340 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.92 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.76 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.21 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.21 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  28.41 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.08 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  21.68 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  28.02 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  24.26 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1021  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3274  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  21.07 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  23.62 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.76 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.24 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.56 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.56 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.61 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.61 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.61 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4852  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.9 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1208  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3955  twin-arginine translocation pathway signal  22.09 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0323  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.37 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0345  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  23.77 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.89 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2377  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0307958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.57 
 
 		 347 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  26.22 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.4 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.15 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  27.55 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.08 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.81 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  24.58 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>