More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3616 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  52.43 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  56.32 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  47.77 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  45.54 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  50.54 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  43.93 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  46.54 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  47.15 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  46.41 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  47.25 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  41.1 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  53.21 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  41.18 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  41.18 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  48.81 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  50.86 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  52.12 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  46.67 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  48.24 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  49.71 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  45.71 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  45.71 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  46.86 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.34 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.36 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  39.62 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  42.45 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  44.22 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  44.06 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  38.75 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.35 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.15 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  38.71 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.62 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  35 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  29.27 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.06 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  29.14 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 		 195 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 		 195 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 		 195 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  35.81 
 
 		 170 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.73 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  29.5 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 		 193 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 		 193 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  29.71 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  28.85 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  33.9 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.36 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  30.61 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.58 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  35.71 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  36.36 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.47 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.92 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  35.61 
 
 		 133 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  31.2 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  26.6 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.14 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  26.76 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  32 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35.19 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  33.09 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.01 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.6 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  23.88 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  28.03 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  28.28 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  31.91 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  33.88 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.15 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.25 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  33.06 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  35.94 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.37 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  27.39 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  33.94 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  43.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.59 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>