More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3275 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.73 
 
 		 260 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.54 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.08 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.2 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.23 
 
 		 651 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.56 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.27 
 
 		 662 aa  105  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.91 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.18 
 
 		 659 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.5 
 
 		 661 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  26.85 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.99 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  26.85 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  29.07 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  29.07 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.45 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.42 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.63 
 
 		 663 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.96 
 
 		 662 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.56 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  27.94 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000176204  normal  0.426622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.15 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.55 
 
 		 662 aa  99  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.56 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  25.87 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>