More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1575 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000176204  normal  0.426622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
260 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
259 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
259 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.05 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.86 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
260 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
260 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.02 
 
 
260 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
260 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
260 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.75 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
259 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
259 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.68 
 
 
260 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
260 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
261 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
258 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 
261 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
258 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
260 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
265 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.57 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.52 
 
 
256 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
260 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
252 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.73 
 
 
662 aa  156  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
260 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.69 
 
 
663 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.72 
 
 
260 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
288 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
260 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
262 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
260 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
264 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
253 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.1 
 
 
662 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
257 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
260 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.33 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.28 
 
 
260 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
257 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
257 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.33 
 
 
661 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
257 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
259 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.51 
 
 
662 aa  148  9e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
258 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
263 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
263 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
258 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.63 
 
 
259 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
258 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
258 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
257 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
258 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
268 aa  145  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
265 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
258 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
256 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
262 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
259 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 
261 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
277 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
260 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
258 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
256 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
265 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
257 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
259 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
259 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.47 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>