290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2614 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
328 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  65.09 
 
 
321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  52.24 
 
 
297 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 
323 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
294 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
297 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
295 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
294 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.72 
 
 
296 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 
297 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
307 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  47.6 
 
 
303 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 
301 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 
296 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
292 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  48.72 
 
 
297 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.79 
 
 
296 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 
295 aa  245  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.11 
 
 
295 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 
298 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
292 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.77 
 
 
297 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.77 
 
 
293 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 
296 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 
296 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 
296 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
299 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.85 
 
 
298 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
295 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
302 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.95 
 
 
297 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
293 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.63 
 
 
292 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 
295 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  35.42 
 
 
297 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.44 
 
 
323 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  35.85 
 
 
301 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 
289 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  29.84 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.03 
 
 
310 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
295 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  31.75 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  45.83 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  47.89 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.31 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.98 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.47 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  29.57 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.09 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4691  NmrA family protein  37.88 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  25.74 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.65 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  44.44 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  26.84 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  24.93 
 
 
318 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
330 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 
337 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  54.9 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>