More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 500 aa  974    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  41.25 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  31.81 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  37.07 
 
 		 425 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  30.16 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 		 458 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 468 aa  153  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  30.85 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.77 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  28.63 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  30.35 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  29.66 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  37.16 
 
 		 540 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 447 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 447 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 447 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  28.94 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 441 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.97 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  25.36 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  27.36 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  31.29 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  29.54 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  25.51 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  25.61 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  24.8 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  25.82 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  25.82 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  27.91 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  28.68 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  25.06 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  24.76 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  22.6 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  26.39 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  23.94 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  23.94 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  23.23 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  24.4 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.71 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  25.14 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.55 
 
 		 441 aa  110  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  25.58 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  25.2 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  23.23 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  25.86 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  26.06 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  26.33 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  24.54 
 
 		 428 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 451 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  25.75 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  24.93 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  23.43 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  24.27 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  25.47 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  21.68 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 449 aa  103  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  26.04 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  25.2 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  25.13 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>