More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24190 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
435 aa  829    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  43.58 
 
 
394 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  43.7 
 
 
383 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  41.29 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
444 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
385 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  40.65 
 
 
372 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  40.05 
 
 
428 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.47 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  41.01 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
382 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 
386 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
381 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.16 
 
 
354 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.05 
 
 
362 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.11 
 
 
354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.11 
 
 
354 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
333 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.48 
 
 
345 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 
430 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.04 
 
 
361 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.44 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.26 
 
 
513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.64 
 
 
393 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.46 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  39.95 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 
448 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.57 
 
 
479 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.61 
 
 
453 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.18 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.99 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.87 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
955 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.2 
 
 
451 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  36.96 
 
 
391 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
561 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
490 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.18 
 
 
474 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
526 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.39 
 
 
463 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.14 
 
 
489 aa  100  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.91 
 
 
495 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.47 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5819  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
507 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28201  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.77 
 
 
498 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 
508 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
497 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.59 
 
 
494 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 
508 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  29.8 
 
 
506 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  27.95 
 
 
1027 aa  93.2  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  29.32 
 
 
485 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.06 
 
 
528 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.13 
 
 
482 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.75 
 
 
500 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.91 
 
 
487 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
508 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.38 
 
 
491 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.72 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.73 
 
 
386 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.57 
 
 
472 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.89 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 
521 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  30.2 
 
 
502 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
523 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
504 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
523 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
504 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.09 
 
 
491 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
504 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
523 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 
522 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  31.13 
 
 
464 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.53 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
502 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  28.17 
 
 
506 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 
502 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  28.57 
 
 
510 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2436  O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.87 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.49 
 
 
492 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
507 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.49 
 
 
492 aa  86.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  28.68 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.93 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
513 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.58 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  28.68 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  37.65 
 
 
798 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  28.79 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  28.68 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>