More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03420  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
233 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
225 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  49.76 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  49.29 
 
 
224 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
224 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
217 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
226 aa  165  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  45.15 
 
 
225 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  43.23 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
224 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
222 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
228 aa  157  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
222 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  45.78 
 
 
231 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
215 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  44.93 
 
 
225 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 
221 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  49.5 
 
 
213 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 
217 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 
221 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  44.75 
 
 
217 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  44.75 
 
 
217 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
217 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  43.07 
 
 
228 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.41 
 
 
223 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
213 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
224 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
217 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.96 
 
 
214 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
223 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0696244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  45.59 
 
 
218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 
218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
214 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.61 
 
 
225 aa  151  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
214 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  44.06 
 
 
217 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
217 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.34 
 
 
217 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1534  D-methionine ABC transporter, permease  43.06 
 
 
229 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
221 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
214 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
222 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10520  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.14 
 
 
226 aa  148  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
227 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
235 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
221 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.57 
 
 
230 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  45.75 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
221 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
221 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
218 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
214 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
227 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
221 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
221 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
221 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
218 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
221 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  45.71 
 
 
217 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  45.71 
 
 
217 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  45.71 
 
 
217 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
227 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  45.71 
 
 
217 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  45.71 
 
 
217 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
227 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  45.89 
 
 
214 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 
224 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
246 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  43.44 
 
 
217 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.41 
 
 
214 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.03 
 
 
217 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
218 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.59 
 
 
217 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.8 
 
 
217 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  44.76 
 
 
217 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  44.76 
 
 
217 aa  141  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  44.76 
 
 
217 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
225 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  44.29 
 
 
217 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
236 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3343  DL-methionine transporter permease subunit  45.24 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.12 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  42.99 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  42.27 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3500  DL-methionine transporter permease subunit  45.24 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000072704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  44.76 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>