More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6957 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6957  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2730  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.87 
 
 		 203 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0201  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.65 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3062  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.52 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.77 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  44.78 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  44.78 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  44.78 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.77 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.84 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.28 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  44.78 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.29 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  44.28 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.76 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  43.52 
 
 		 200 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  43.07 
 
 		 722 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  42.5 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  40.5 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  42.5 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.79 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  42.78 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  42.38 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  42.27 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  42.27 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3458  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.03 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09800  3-isopropylmalate dehydratase small subunit LeuD2  45.77 
 
 		 202 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  43.98 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  43.93 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  43.93 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.86 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  42.99 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  42.23 
 
 		 801 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  42.33 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  43.46 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  43.46 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  43.46 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  43.46 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  44.88 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.33 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4326  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.79 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  43.6 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  43.6 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.43 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  42.38 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  40.41 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  46.43 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  42.38 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  42.38 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  42.33 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  42.86 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>