More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2521 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  59.76 
 
 
575 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1181    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  89.26 
 
 
598 aa  996    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  59.06 
 
 
740 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  59.58 
 
 
575 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  59.41 
 
 
575 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.76 
 
 
595 aa  952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.85 
 
 
598 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.91 
 
 
596 aa  952    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.84 
 
 
582 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  51.84 
 
 
582 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_003296  RS02988  hypothetical protein  47.75 
 
 
478 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118502  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3883  putative transmembrane protein  46.15 
 
 
308 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.514734 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3996  hypothetical protein  46.15 
 
 
308 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.92 
 
 
936 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
703 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 
700 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 
700 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
700 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
347 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  42.29 
 
 
687 aa  186  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  41.28 
 
 
683 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
541 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
703 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
707 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  43.65 
 
 
619 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
684 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  44.26 
 
 
680 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  43.65 
 
 
680 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  47.13 
 
 
383 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
671 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  44.54 
 
 
515 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
448 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  50.69 
 
 
273 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  42.06 
 
 
373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
366 aa  173  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
665 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
1168 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
490 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
509 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  40.17 
 
 
458 aa  161  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
748 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
363 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
492 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
394 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  41.2 
 
 
463 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
462 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  41.2 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  41.2 
 
 
463 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
363 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  41.2 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
462 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  41.2 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  41.2 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
489 aa  157  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  41.7 
 
 
463 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.93 
 
 
640 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
795 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
493 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
384 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
795 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
795 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
546 aa  150  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  42.29 
 
 
797 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
748 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  41.33 
 
 
795 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  36.13 
 
 
565 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
799 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  42.48 
 
 
799 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
384 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
535 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  39.46 
 
 
387 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
370 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
801 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  36.89 
 
 
379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  34.83 
 
 
466 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  40.87 
 
 
489 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
521 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  34.83 
 
 
460 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  39.06 
 
 
1809 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
364 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  35.03 
 
 
410 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
479 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  34.64 
 
 
772 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
357 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  35.38 
 
 
377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
662 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
372 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
357 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
770 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
410 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
692 aa  136  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.6 
 
 
662 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  39.45 
 
 
671 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>