30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3996 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3996  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3883  putative transmembrane protein  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.514734 
 
 
-
 
NC_003296  RS02988  hypothetical protein  78.86 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118502  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  47.77 
 
 		 575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  47.77 
 
 		 575 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  48.09 
 
 		 575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  46.52 
 
 		 740 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 594 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 936 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 596 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 595 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  46.8 
 
 		 582 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 582 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 598 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  46.58 
 
 		 598 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 538 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0276  diguanylate cyclase  34.8 
 
 		 462 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3178  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0366604  hitchhiker  0.0000463802 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0185  diguanylate cyclase  34.46 
 
 		 462 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3160  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 452 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.413104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2546  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 452 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1650  hypothetical protein  34.46 
 
 		 462 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6515  diguanylate cyclase  33.57 
 
 		 452 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683766  normal  0.600963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 466 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 807 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3096  diguanylate cyclase  32.87 
 
 		 452 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200719  hitchhiker  0.00269086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3212  diguanylate cyclase  32.87 
 
 		 452 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0208  GGDEF domain-containing protein  33.96 
 
 		 462 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3143  hypothetical protein  30 
 
 		 459 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>