More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4404 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  71.35 
 
 
547 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
565 aa  1128    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  96.81 
 
 
570 aa  1047    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  96.81 
 
 
570 aa  1047    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.62 
 
 
605 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.43 
 
 
552 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.46 
 
 
580 aa  273  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  34.59 
 
 
547 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.81 
 
 
555 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.64 
 
 
542 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.64 
 
 
542 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 
587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 
530 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  40.27 
 
 
497 aa  250  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  36.61 
 
 
514 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.72 
 
 
554 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.72 
 
 
554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.72 
 
 
554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.49 
 
 
554 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.64 
 
 
554 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  33.64 
 
 
554 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.72 
 
 
554 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  33.41 
 
 
554 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.48 
 
 
569 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.4 
 
 
622 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.42 
 
 
568 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.42 
 
 
573 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.42 
 
 
573 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.54 
 
 
618 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.97 
 
 
615 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 
520 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.68 
 
 
507 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.42 
 
 
509 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.48 
 
 
569 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.64 
 
 
561 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  41.31 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.49 
 
 
503 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  34.74 
 
 
525 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.58 
 
 
530 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.26 
 
 
520 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.4 
 
 
511 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.02 
 
 
574 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 
503 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  36.01 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  36.62 
 
 
537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.43 
 
 
555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  38.4 
 
 
481 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.48 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.89 
 
 
537 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.5 
 
 
555 aa  189  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 
564 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.86 
 
 
523 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.97 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  34.73 
 
 
553 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.38 
 
 
481 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 
493 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 
511 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33.91 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 
586 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  34.94 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.14 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.27 
 
 
388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.22 
 
 
510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  32.95 
 
 
475 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 
531 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.18 
 
 
535 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 
518 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 
592 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 
475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
547 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
541 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
555 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 
533 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 
576 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.8 
 
 
566 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 
477 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.31 
 
 
552 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 
461 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
545 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 
522 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.16 
 
 
556 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
598 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.86 
 
 
541 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.08 
 
 
489 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  31.94 
 
 
485 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
535 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>