73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4117 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4117  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
297 aa  584  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.723284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.82 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.83 
 
 
6885 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  27.97 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  27.97 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.42 
 
 
1887 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.78 
 
 
455 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  26.81 
 
 
455 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.85 
 
 
455 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  27.23 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  26.81 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  27.23 
 
 
455 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  27.23 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  34.05 
 
 
762 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  37.74 
 
 
1154 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.33 
 
 
459 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  26.81 
 
 
455 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  35.11 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  26.81 
 
 
455 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.73 
 
 
809 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 
1137 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  27.74 
 
 
2286 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  30.93 
 
 
561 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  42.11 
 
 
562 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  43.02 
 
 
1121 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 
1209 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  43.75 
 
 
544 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  28.93 
 
 
667 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.88 
 
 
1221 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.45 
 
 
795 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.27 
 
 
456 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 
1004 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.37 
 
 
973 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.5 
 
 
2170 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  38.02 
 
 
651 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.23 
 
 
743 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.93 
 
 
458 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  35.24 
 
 
831 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.71 
 
 
729 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  24.68 
 
 
456 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 
1307 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  39.33 
 
 
655 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.95 
 
 
674 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.83 
 
 
503 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  27.05 
 
 
1695 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  35.96 
 
 
854 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  45.98 
 
 
1298 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.71 
 
 
674 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 
674 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  37.18 
 
 
608 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  43.02 
 
 
703 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.46 
 
 
674 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.56 
 
 
998 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  28.69 
 
 
1238 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 
658 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.78 
 
 
703 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  33 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.68 
 
 
674 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.61 
 
 
1462 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  34.83 
 
 
924 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  30.95 
 
 
674 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  30.95 
 
 
674 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  36.9 
 
 
768 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  30.1 
 
 
1428 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  30.95 
 
 
674 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  30.95 
 
 
674 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.19 
 
 
465 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  30.43 
 
 
614 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  33.71 
 
 
552 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  38.2 
 
 
662 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.11 
 
 
464 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  37.18 
 
 
649 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>