More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2547 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  100 
 
 		 434 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  71.69 
 
 		 441 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  70.48 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  71.46 
 
 		 424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  68.39 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  62.7 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  62.95 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  62.95 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  62.95 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  61.99 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  62.05 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.45 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  60.32 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  56.53 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  59.9 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  58.88 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  58.88 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  63.64 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  54.15 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  55.07 
 
 		 478 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  57.45 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  55.85 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  53 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  58.04 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  54.86 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  53.66 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  53.12 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  52.14 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  52.13 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.76 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  50.69 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  53.59 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  56.43 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  57.08 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  56.37 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  51.66 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.98 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.76 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.5 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  48.97 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.05 
 
 		 494 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  47.88 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  49.76 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  50.49 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  47.22 
 
 		 515 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.63 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.56 
 
 		 457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.33 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  51.71 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.22 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  47.22 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  48.33 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.94 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  48.11 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.4 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  46.7 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  47.74 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.88 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.27 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.69 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.24 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  46.34 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.06 
 
 		 466 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.06 
 
 		 500 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.06 
 
 		 466 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  49.28 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.06 
 
 		 500 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.06 
 
 		 466 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.06 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.06 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.99 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.06 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.73 
 
 		 436 aa  329  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.44 
 
 		 477 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.6 
 
 		 515 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  46.14 
 
 		 397 aa  328  9e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  45.6 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.22 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  47.66 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  49.06 
 
 		 504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  48.46 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  48.59 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  47.39 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  46.19 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  48.59 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  48.59 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  47.73 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  48.56 
 
 		 480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  45.95 
 
 		 452 aa  326  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  47.27 
 
 		 461 aa  325  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  46.98 
 
 		 476 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  47.1 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  48.84 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.36 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  45.52 
 
 		 513 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  48.95 
 
 		 502 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  49.76 
 
 		 476 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  42.86 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  49.76 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>