More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1325 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.49 
 
 
571 aa  737    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  60.75 
 
 
559 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  61.65 
 
 
539 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  62.43 
 
 
536 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  100 
 
 
572 aa  1134    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.2 
 
 
562 aa  755    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  66.19 
 
 
561 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  60.57 
 
 
554 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  67.74 
 
 
558 aa  700    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  65.05 
 
 
564 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  65.83 
 
 
569 aa  730    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  64.16 
 
 
539 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  67.2 
 
 
560 aa  722    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  65.23 
 
 
560 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  66.08 
 
 
574 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  61.83 
 
 
544 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  57.58 
 
 
555 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  57.71 
 
 
542 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  56.11 
 
 
553 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  60.89 
 
 
543 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
488 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.74 
 
 
767 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.54 
 
 
643 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.77 
 
 
622 aa  203  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  31.25 
 
 
645 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.19 
 
 
636 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.57 
 
 
620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.21 
 
 
540 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.09 
 
 
543 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  27.22 
 
 
621 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  28.6 
 
 
666 aa  190  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.03 
 
 
540 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.87 
 
 
544 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.25 
 
 
668 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.7 
 
 
543 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.53 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.44 
 
 
634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  28.68 
 
 
530 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  28.34 
 
 
631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  30.15 
 
 
631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  33.69 
 
 
533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  27.89 
 
 
630 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  29.53 
 
 
557 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  27.22 
 
 
646 aa  183  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.33 
 
 
640 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  28.97 
 
 
690 aa  183  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 
631 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.46 
 
 
549 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  29.6 
 
 
531 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.16 
 
 
636 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  27.69 
 
 
631 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  27.69 
 
 
631 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  33.46 
 
 
657 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 
627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 
641 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  28.17 
 
 
688 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.32 
 
 
641 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  30.26 
 
 
529 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  29.55 
 
 
649 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.84 
 
 
649 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.29 
 
 
672 aa  180  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  28.06 
 
 
631 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  28.86 
 
 
530 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.44 
 
 
659 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  25.54 
 
 
620 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.88 
 
 
532 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  32.63 
 
 
545 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  28.91 
 
 
647 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  33.27 
 
 
537 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  28.68 
 
 
530 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.68 
 
 
615 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  30.02 
 
 
541 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  30.15 
 
 
528 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
545 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.41 
 
 
659 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.87 
 
 
634 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  27.78 
 
 
652 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  31 
 
 
542 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.3 
 
 
632 aa  176  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  29.39 
 
 
651 aa  176  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  27.19 
 
 
644 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  28.6 
 
 
643 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.37 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  35.81 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.78 
 
 
653 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  26.71 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  26.71 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  29.73 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  28.52 
 
 
644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  28.44 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  28.29 
 
 
575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  29.39 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.73 
 
 
645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>