209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0861 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
404 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  57.72 
 
 
417 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  43.72 
 
 
405 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 
405 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  47.48 
 
 
690 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  42.3 
 
 
412 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  37.87 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  42.33 
 
 
432 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  37.96 
 
 
430 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  36 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  29.87 
 
 
441 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.44 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.93 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.97 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.47 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.29 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  27.22 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  21.73 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.57 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.39 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.17 
 
 
407 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.57 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
425 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  32.12 
 
 
417 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  26.83 
 
 
446 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  33.09 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  24.83 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
439 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  26.36 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  25.37 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.92 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.55 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.89 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.2 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  26.06 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.56 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
415 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  26.97 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  25.21 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 
489 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  19.75 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  22.28 
 
 
399 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.56 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  23.36 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.44 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  26.41 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  26.41 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  18.77 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.79 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  25.26 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  22.67 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  19.37 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  19.75 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.14 
 
 
416 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  25.13 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.41 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.15 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  18.77 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.15 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.19 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  22.81 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  19.05 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.09 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  28.06 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  31.39 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  31.39 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  26.55 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  31.39 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  20.38 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.04 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>