More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5262 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  91.45 
 
 		 399 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  95.49 
 
 		 424 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 399 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  98.75 
 
 		 399 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  95.74 
 
 		 399 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  95.49 
 
 		 399 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  70.38 
 
 		 398 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  68.1 
 
 		 398 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  52.97 
 
 		 407 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  49.37 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  46.84 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  52.88 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  52.88 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  52.88 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  52.56 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 402 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  46.8 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 		 395 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  44.81 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  47.22 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  49.75 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  49.75 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  49.75 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  49.75 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 396 aa  316  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 396 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  44.56 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  42.26 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  41.19 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 395 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.28 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  43.27 
 
 		 393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.66 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.42 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 400 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  41.42 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  41.95 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  41.69 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  41.18 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.95 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.95 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.64 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.95 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.95 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.95 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.85 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.95 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.99 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.38 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  39.84 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 403 aa  255  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.02 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 406 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.75 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 405 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>