More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4083 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1320  amidase  76.69 
 
 		 497 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  78.27 
 
 		 484 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  92.31 
 
 		 494 aa  935    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  76.69 
 
 		 546 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  78.06 
 
 		 484 aa  732    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  92.31 
 
 		 494 aa  933    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  77.75 
 
 		 497 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  90.69 
 
 		 494 aa  920    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  78.06 
 
 		 484 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  78.06 
 
 		 484 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  78.06 
 
 		 484 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  92.31 
 
 		 494 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  98.79 
 
 		 494 aa  994    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  100 
 
 		 494 aa  1004    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  92.31 
 
 		 494 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  63.12 
 
 		 556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  60.32 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  59.45 
 
 		 496 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  59.67 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  58.16 
 
 		 494 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  59.87 
 
 		 485 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  58.04 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  58.63 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  56.45 
 
 		 485 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  56.57 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  53.68 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  52.63 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  55.53 
 
 		 521 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  53.53 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  53.7 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  52.49 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  53.49 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  53.68 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  51.48 
 
 		 495 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  46.32 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  51.45 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  47.6 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  47.67 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  47.67 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  47.53 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  45.4 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  49.47 
 
 		 463 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  47.97 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  45.97 
 
 		 459 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  44.42 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  43.15 
 
 		 487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  43.8 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.98 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  42.71 
 
 		 479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  41.47 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  40.04 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  42.77 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40.58 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  38.68 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  39.69 
 
 		 477 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.21 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  41.44 
 
 		 509 aa  266  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  36.97 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  41.08 
 
 		 498 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  40.21 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  35.91 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  39.79 
 
 		 516 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  39.79 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  39.83 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  37.58 
 
 		 471 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  38.2 
 
 		 507 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.76 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  37.71 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  39.01 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  39.87 
 
 		 507 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  38.98 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  39.66 
 
 		 508 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.93 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.24 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.97 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  37.02 
 
 		 506 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.8 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.15 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.8 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.22 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  35.48 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  36.34 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.92 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  37.61 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.93 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.12 
 
 		 485 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  33.69 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  37.23 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.19 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.12 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.41 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.93 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.92 
 
 		 483 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.72 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  32.99 
 
 		 486 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.21 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.56 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.53 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.72 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>