More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5814 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  98.25 
 
 		 400 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 400 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 396 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 393 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 402 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.51 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 395 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  41.88 
 
 		 399 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 398 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  42.82 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 398 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 399 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 398 aa  286  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  41.62 
 
 		 424 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  38.23 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 399 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  41.36 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  40.87 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  42.23 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  38.85 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  40 
 
 		 417 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  41.45 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.3 
 
 		 406 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  40.46 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.92 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  40.16 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.84 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  39.9 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  39.9 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.14 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.79 
 
 		 404 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.83 
 
 		 463 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 397 aa  255  7e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  37.79 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.86 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.69 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 416 aa  252  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.42 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  39.95 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.95 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.7 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  36.43 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  36.43 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  36.43 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  36.43 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  36.43 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>