199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0936 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  99.75 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.75 
 
 		 395 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  92.41 
 
 		 395 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.75 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 395 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 395 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.75 
 
 		 395 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.5 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  63.03 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  63.09 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  63.03 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  62.53 
 
 		 404 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  62.25 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  62.44 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  37.98 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  37.94 
 
 		 367 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  36.89 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  36.34 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  38.25 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  37.98 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  34.15 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.24 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  34.51 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  32.7 
 
 		 369 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  29.16 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  30.08 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.1 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  29.43 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.1 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  32.98 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 664 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  27.83 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  30.26 
 
 		 1498 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  27.07 
 
 		 665 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.76 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  29.86 
 
 		 1188 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  29.62 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  31.67 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  31.67 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  29.86 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  29.86 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 		 1500 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.97 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  27.46 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.12 
 
 		 661 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 320 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  23.33 
 
 		 1449 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.7 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  31.82 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.77 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  28.7 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.3 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  26.3 
 
 		 1077 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  27.15 
 
 		 659 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  26.3 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1485 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.1 
 
 		 330 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.45 
 
 		 321 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.59 
 
 		 1454 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 		 668 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 333 aa  51.2  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.45 
 
 		 1506 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.12 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  25 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>