117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1183 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  94.12 
 
 
357 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  94.4 
 
 
357 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  100 
 
 
357 aa  713    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  94.4 
 
 
357 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  95.04 
 
 
344 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  94.68 
 
 
357 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  94.68 
 
 
357 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  94.4 
 
 
357 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  74.77 
 
 
353 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  74.46 
 
 
353 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  74.46 
 
 
353 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  73.23 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  74.68 
 
 
353 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  74.68 
 
 
353 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  66.09 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  74.29 
 
 
353 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  68.92 
 
 
297 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  64.57 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  48.97 
 
 
294 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  47.59 
 
 
294 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  47.96 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  43.36 
 
 
293 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 
291 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  38.03 
 
 
285 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 
293 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  39.36 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  38.41 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  37.19 
 
 
289 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  36.65 
 
 
356 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  37.32 
 
 
289 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  37.89 
 
 
289 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  36.18 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  36.33 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  36.33 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  36.33 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  36.33 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  36.33 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  35.67 
 
 
290 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
290 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  36.33 
 
 
290 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  35.03 
 
 
382 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  38.89 
 
 
296 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  37 
 
 
282 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  38.46 
 
 
296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  32.88 
 
 
309 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  34.36 
 
 
296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  33.56 
 
 
310 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  32.65 
 
 
299 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  31.99 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  33 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  30.52 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.48 
 
 
305 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  29.14 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  31.67 
 
 
323 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 
298 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.87 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  31.46 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  27.02 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  24.3 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  24.3 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  24.3 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  28.1 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  25.2 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  25.57 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  25.57 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  25.2 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  25.57 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.95 
 
 
290 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.33 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  27.73 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  29.11 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  30.19 
 
 
280 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  29.25 
 
 
280 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.27 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  31.78 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  30.7 
 
 
294 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.81 
 
 
289 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  21.35 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  29.91 
 
 
311 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  22.42 
 
 
295 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  22.42 
 
 
295 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  30.07 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  22.95 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  30.3 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  25.39 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  21.45 
 
 
291 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.83 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.1 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  30.28 
 
 
325 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  27.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.8 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>