182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0753 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0753  citrate synthase family protein  100 
 
 
327 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  78.53 
 
 
501 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  86.49 
 
 
450 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  85.81 
 
 
450 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  85.81 
 
 
453 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  85.81 
 
 
453 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  66.11 
 
 
410 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  66.11 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  66.67 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  66.67 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  66.11 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  64.14 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  59.18 
 
 
545 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  68.92 
 
 
410 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  58.5 
 
 
413 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  53.15 
 
 
397 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  49.23 
 
 
429 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  43.23 
 
 
406 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  51.79 
 
 
395 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  53.51 
 
 
402 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  49.55 
 
 
391 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  52 
 
 
426 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  50.89 
 
 
410 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  42.14 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  46.67 
 
 
381 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  48.67 
 
 
381 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  88.24 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  46.49 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  42.99 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  43.24 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  40.98 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  42.34 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  41.12 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  41.6 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  37.18 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  37.9 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  39.09 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  39.09 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  37.7 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  43.52 
 
 
382 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  38.18 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  39.82 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  34.86 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  30.69 
 
 
418 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  30 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  36.44 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  56.52 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1730  DNA binding domain protein, excisionase family  32.37 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0738668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  67.74 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  59.38 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
387 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  62.5 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50 
 
 
379 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  62.5 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  56.25 
 
 
373 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  56.25 
 
 
373 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  51.11 
 
 
481 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  62.5 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  59.38 
 
 
379 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  53.12 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.52 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  57.14 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  51.11 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  47.83 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  47.5 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  50 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  51.11 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  51.11 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  57.58 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  50 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  50 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  50 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  56.25 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  55.88 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  37.14 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  59.38 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  55.88 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  50 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  55.88 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  55.26 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  52.5 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  57.58 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  59.38 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  60.61 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  59.38 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  59.38 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  51.52 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  60.61 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>