More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1948 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.77 
 
 
635 aa  736    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  49.63 
 
 
640 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  100 
 
 
671 aa  1383    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  57.32 
 
 
650 aa  780    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  52.47 
 
 
629 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1238  ABC transporter related  50.52 
 
 
631 aa  646    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  54.95 
 
 
639 aa  706    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
632 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1122  ABC transporter, ATP-binding protein  58.43 
 
 
683 aa  794    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  48.41 
 
 
638 aa  617  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.59 
 
 
616 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1222  ABC transporter related protein  49.47 
 
 
608 aa  595  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  43.16 
 
 
621 aa  525  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  44.34 
 
 
606 aa  523  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  42.96 
 
 
630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
618 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  35.6 
 
 
626 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.71 
 
 
677 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.77 
 
 
691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
600 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.91 
 
 
597 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.91 
 
 
597 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  35.03 
 
 
582 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  37 
 
 
620 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  35.38 
 
 
631 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 
637 aa  385  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  35.06 
 
 
631 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.6 
 
 
632 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  35.06 
 
 
631 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  33.23 
 
 
636 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  36.9 
 
 
620 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 
589 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  33.44 
 
 
628 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  36.51 
 
 
672 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.07 
 
 
593 aa  372  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  32.09 
 
 
619 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  35.91 
 
 
606 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  34.83 
 
 
695 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.49 
 
 
634 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.25 
 
 
614 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.18 
 
 
613 aa  360  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  36.22 
 
 
642 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.3 
 
 
625 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
605 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
586 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.55 
 
 
595 aa  355  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  33.69 
 
 
584 aa  354  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  36.92 
 
 
621 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  35.82 
 
 
625 aa  353  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  35.83 
 
 
680 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.01 
 
 
615 aa  350  6e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  35.19 
 
 
653 aa  347  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.12 
 
 
702 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.63 
 
 
607 aa  345  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
598 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  36.97 
 
 
601 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  33.39 
 
 
671 aa  340  5.9999999999999996e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  34.23 
 
 
614 aa  337  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  34.92 
 
 
675 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  32.09 
 
 
618 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 
618 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
733 aa  333  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  32.83 
 
 
631 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
661 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  34.18 
 
 
613 aa  330  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.79 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.07 
 
 
556 aa  328  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.39 
 
 
666 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  31.34 
 
 
627 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.61 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  35.26 
 
 
646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.52 
 
 
635 aa  320  7e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.79 
 
 
594 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 
672 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 
721 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  30.09 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 
589 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.98 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.22 
 
 
652 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  59.49 
 
 
617 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  57.36 
 
 
620 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.9 
 
 
587 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1070  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.43 
 
 
577 aa  301  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00802304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  31.07 
 
 
613 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.84 
 
 
594 aa  299  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.25 
 
 
582 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  30.9 
 
 
611 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  30.15 
 
 
606 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.69 
 
 
581 aa  297  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.81 
 
 
609 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.17 
 
 
572 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  30.57 
 
 
624 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  30.5 
 
 
592 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.51 
 
 
587 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.16 
 
 
609 aa  293  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.35 
 
 
587 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.35 
 
 
588 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  53.76 
 
 
609 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  32.05 
 
 
603 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  32.45 
 
 
593 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>