More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1682 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1269    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  58.81 
 
 		 607 aa  713    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.6 
 
 		 593 aa  674    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  61.94 
 
 		 619 aa  779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  56.68 
 
 		 597 aa  675    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  52.12 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  51.86 
 
 		 625 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.43 
 
 		 618 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  51.77 
 
 		 618 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  50.81 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.58 
 
 		 637 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  49.08 
 
 		 636 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.82 
 
 		 637 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.51 
 
 		 608 aa  580  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  52.28 
 
 		 624 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  48.65 
 
 		 628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  51.01 
 
 		 627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  47.97 
 
 		 631 aa  568  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  48.66 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  45.26 
 
 		 628 aa  555  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  46.8 
 
 		 613 aa  549  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  42.97 
 
 		 671 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  45.39 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  40.92 
 
 		 765 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  41.13 
 
 		 649 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.15 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  46.49 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  42.7 
 
 		 672 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  41.44 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 811 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  40.35 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  40.22 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  43.24 
 
 		 665 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.71 
 
 		 702 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  45.3 
 
 		 593 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 598 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  40.98 
 
 		 652 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 663 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  42.57 
 
 		 606 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  40.41 
 
 		 653 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.62 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 661 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  42.71 
 
 		 584 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.8 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 733 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  41.51 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  40.66 
 
 		 663 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.5 
 
 		 575 aa  462  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  40.64 
 
 		 615 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  39.53 
 
 		 701 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  41.02 
 
 		 631 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.07 
 
 		 615 aa  461  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  41.02 
 
 		 631 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  42.28 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  39.97 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  40.7 
 
 		 631 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.91 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.41 
 
 		 721 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  39.65 
 
 		 680 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  39.16 
 
 		 634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  39.93 
 
 		 614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 591 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.74 
 
 		 598 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.55 
 
 		 617 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  40.13 
 
 		 605 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  42.75 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.68 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.33 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.89 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  39.14 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  39.07 
 
 		 642 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.24 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  40.03 
 
 		 646 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  40.33 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.57 
 
 		 595 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  40.14 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  40.31 
 
 		 598 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.73 
 
 		 691 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  40.14 
 
 		 598 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  42.03 
 
 		 621 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  43.26 
 
 		 675 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  40.11 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  40.76 
 
 		 620 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.59 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  42.97 
 
 		 620 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.58 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  37.82 
 
 		 639 aa  392  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 618 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  38.66 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  34.84 
 
 		 650 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 600 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.5 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>