More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7638 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 501 aa  1011    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.51 
 
 		 520 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  79.28 
 
 		 520 aa  819    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.9 
 
 		 518 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.3 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.98 
 
 		 527 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.18 
 
 		 527 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.51 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.56 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.07 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.78 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.57 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.66 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.41 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  47.01 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.83 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.61 
 
 		 509 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.57 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.01 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.57 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.5 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.28 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.8 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  48.64 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.64 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.5 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.22 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.92 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  45.51 
 
 		 514 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.51 
 
 		 516 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.2 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.3 
 
 		 517 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.82 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  39.33 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.33 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 526 aa  326  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.56 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.56 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 515 aa  320  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.89 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 521 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.83 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.12 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.74 
 
 		 530 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.12 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  35.39 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.12 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.12 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  35.48 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  35.33 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  35.12 
 
 		 526 aa  303  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 525 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
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NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.1 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 526 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 532 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 		 530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  35.12 
 
 		 511 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 511 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  35.12 
 
 		 511 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  35.48 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 		 519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 511 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
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NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 511 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  35.32 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  35.55 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  35.55 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 512 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  35.09 
 
 		 512 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.84 
 
 		 519 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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