98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7233 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7233  putative flagellar L-ring protein FlgH  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  31.72 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  32.61 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  30.94 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  31.39 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  30.4 
 
 		 252 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  31.42 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  33.68 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  33.5 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  33.16 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 246 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  30.13 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 246 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  28.42 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  27.55 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  27.45 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  28.24 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  27.93 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  23.08 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  29.67 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  27.57 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  25.13 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  27.89 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  26.11 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  25.11 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  27.69 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  27.19 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  26.37 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  24.67 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  27.32 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  24.67 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  29.25 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  26.76 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  25.68 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  22.32 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  25.79 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1203  flagellar L-ring protein  24.65 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1252  flagellar L-ring protein  24.65 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  26.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  23.61 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  25.11 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  27.07 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  27.5 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  25 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  27 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  23.83 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  24.77 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  28.17 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  28.17 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  28.17 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  26.98 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  28.17 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  25.45 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  27.46 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  23.45 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  27.51 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  27.46 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  27.57 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  23.66 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  25.81 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  25.52 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  25.81 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  23.83 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  26.27 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  23.83 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  23.59 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  25.55 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  28.29 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  23.83 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  25.26 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  27.39 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  27.45 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  25.7 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  22.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  26.64 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  27.45 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  24.62 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  24.27 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  24.46 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  30.14 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  22.11 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  25.56 
 
 		 224 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  24.77 
 
 		 224 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2235  flagellar L-ring protein  26.81 
 
 		 193 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  28.27 
 
 		 238 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  23 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  23 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>