210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3833 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  99.58 
 
 
238 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  56.09 
 
 
249 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  50.83 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  58.64 
 
 
237 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  46.86 
 
 
224 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  45.92 
 
 
233 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  50.27 
 
 
243 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 
232 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  38.59 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  39 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  39 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  40.97 
 
 
237 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.4 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.96 
 
 
219 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  36.1 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  36.71 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  36.2 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
232 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.62 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  35.84 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  34.31 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  34.31 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  35.04 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  37.21 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  36.49 
 
 
222 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
221 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
221 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
221 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
221 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
221 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  36.74 
 
 
230 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
229 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
229 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  35.02 
 
 
235 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  34.18 
 
 
228 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  36.32 
 
 
232 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  36.32 
 
 
235 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  36.32 
 
 
232 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  37.32 
 
 
236 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 
232 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 
235 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 
232 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 
232 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 
239 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
240 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
240 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 
237 aa  121  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
240 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
238 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
238 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
222 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
232 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  38.3 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.88 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.19 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  34.43 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  32.07 
 
 
234 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  31.3 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  31.3 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
230 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  31.67 
 
 
229 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  31.95 
 
 
232 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  30.13 
 
 
226 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  29.41 
 
 
224 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
230 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  30 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  29.83 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  30.99 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  30.97 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  29.29 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  30.26 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  29.41 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  31.86 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  27.85 
 
 
250 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  30.34 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  34.2 
 
 
207 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  30.71 
 
 
229 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.38 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  34.2 
 
 
207 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  30.26 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.13 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  31.71 
 
 
230 aa  92  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  31.95 
 
 
231 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  31.54 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.71 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  30.87 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  29.54 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  30.88 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>