291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4061 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  69.92 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  61.19 
 
 		 136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.78 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  31.9 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  36.54 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  27.78 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.43 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2149  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.24 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.45 
 
 		 451 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 685 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 738 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 459 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  32.79 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1155 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 737 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3669  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 454 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 675 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1528  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.32 
 
 		 479 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.163365  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 1159 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.67 
 
 		 461 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1161 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1151 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0174  putative PAS/PAC sensor protein  22.48 
 
 		 498 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  33.73 
 
 		 219 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0183  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.47 
 
 		 387 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 705 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 457 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  28.57 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1195 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.12 
 
 		 456 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0187  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.44 
 
 		 457 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  28.99 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.76 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2171  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 408 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.189433  normal  0.293545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 707 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  26.67 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  29.17 
 
 		 575 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  30.53 
 
 		 1361 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  27.1 
 
 		 334 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.42 
 
 		 453 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  24.19 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  24.77 
 
 		 1374 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  27.07 
 
 		 394 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_002950  PG0928  response regulator  30.3 
 
 		 518 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1010 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0068  two component Fis family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 		 236 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 458 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  28 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 681 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  27.07 
 
 		 394 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  32.93 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0751  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 490 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1362 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  25.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0341  two component transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 2107 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 232 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.17 
 
 		 223 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3002  two component Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.37 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  27.13 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3140  response regulator receiver protein  30 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.17 
 
 		 223 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  28.24 
 
 		 230 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  29.11 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 224 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  26.61 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3494  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 		 393 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0163  response regulator  30.77 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  22.58 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 704 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>