More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3175 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  516  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  70.16 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  69.77 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  68.85 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  70.16 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  50 
 
 		 274 aa  254  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  50.76 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  48.5 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  50.56 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  47.73 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  47.35 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  49.06 
 
 		 277 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  41.44 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  40.67 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 287 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  41.74 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.91 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.01 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.88 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.61 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.33 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  36.67 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.16 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.09 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.16 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.97 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 425 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>